منذ عام 1948 وحتى عام 1967 لم تنشأ في قطاع غزة مؤسسات للتعليم العالي، وكان أبناء القطاع يدرسون في الجامعات المصرية بلا عوائق، إلا أنه بعد عام 1967 وجد أهل القطاع صعوبات جمة في إرسال أبنائهم إلى الخارج، الأمر الذي دفع أهل الخير من رجالات قطاع غزة للتفكير في إنشاء جامعة تخدم أبناءهم وترتقي بمستوى التعليم في قطاع غزة خاصة، وفلسطين عامة، ومن هنا جاءت فكرة إنشاء الجامعة الإسلامية.

نشأت الجامعة الإسلامية بغزة عام 1978 انبثاقاً عن معهد فلسطين الديني، الذي أنشئ عام 1954، وظلت الجامعة إلى عام 1991م الجامعة الوحيدة التي تخدم قطاع غزة الذي يقطن فيه الآن قرابة مليون ونصف المليون نسمة.

        بدأت الجامعة الإسلامية بثلاث كليات هي: كلية الشريعة التي أصبحت لاحقاً كلية الشريعة والقانون، وكلية أصول الدين، وكلية اللغة العربية التي أصبحت لاحقاً كلية الآداب، ونظراً لحاجة لمجتمع الفلسطيني الماسة إلى التخصصات الأخرى فقد تم في عام 1980م افتتاح ثلاث كليات أخرى هي: التربية، والتجارة، والعلوم، ثم افتتحت كلية الهندسة عام 1992م، وكلية التمريض مطلع العام الدراسي 1992-1993م، وكلية الطب مطلع العام الدراسي 2006-2007م.

        وعلى مدار تلك السنوات شهدت الجامعة تطوراً في هيئتيها الأكاديمية والإدراية، وأعداد طلبتها وخريجيها، إلى جانب مرافقها، ووحداتها، ومختبراتها، وخدماتها في مجالي البحث العلمي والتنمية المجتمعية، علاوة على علاقاتها الوطنية والإقليمية والعالمية.